Agentka specjalna Jane Tennant (Vanessa Lachey) i jej podwładni zmagają się ze sprawami kryminalnymi w Pearl Harbor na Hawajach. Śledztwa dotyczą ewentualnych zagrożeń dla bezpieczeństwa narodowego Stanów Zjednoczonych. Funkcjonariuszom pomagają wykwalifikowani specjaliści i lokalni mieszkańcy.O pomoc prosi zespół NCIS narzeczona zaginionego oficera marynarki wojennej. Badając sprawę, funkcjonariusze odkrywają, że żołnierz skrywał znacznie większe sekrety, niż jego ukochana przypuszczała. Tymczasem Sam chce, by Kai pomógł mu przy podrywie.