Leonardo, Raphael, Michelangelo i Donatello znają wschodnią sztukę walki ninjutsu. Wychował ich i wytrenował zmutowany szczur - mistrz Splinter. Przyjaciele mają swoją kryjówkę na przedmieściach Nowego Jorku. Ich łączniczką z miastem jest nastoletnia April O'Neil. Żołwie codziennie stawiają czoło licznym wrogom i walczą z zagrożeniami. W wolnym czasie zajadają się ulubioną pizzą.Mikey postanawia uciec z domu. Zaprzyjaźnia się ze zmutowaną żabą, która ma niecne plany. Z pomocą swoich krewnych zamierza podbić cały świat. Żółw postanawia do tego nie dopuścić.