Jupiter Jones rodzi się nocą, a całemu zdarzeniu towarzyszą cudowne znaki, które świadczą, że dokona kiedyś rzeczy wielkich. Mijają lata. Dorosła Jupiter mieszka w Chicago. Wciąż ma ogromne marzenia, ale życie jej nie rozpieszcza. Dziewczyna wykonuje pracę sprzątaczki i ma za sobą nieudane związki. Sytuacja ulega zmianie, gdy Ziemię odwiedza tajemniczy Caine Wise. To modyfikowany genetycznie wojskowy zwiadowca, którego celem jest odnalezienie Jupiter. Wówczas na jaw wychodzi przeznaczenie dziewczyny. Okazuje się, że w jej kodzie genetycznym zapisano niecodzienne dziedzictwo. Może ono mieć znaczący wpływ na układ sił w całym wszechświecie. Z tego właśnie powodu dziewczyna staje się celem okrutnego Balema, który zamierza się jej pozbyć.