Agentka specjalna Jane Tennant (Vanessa Lachey) i jej podwładni zmagają się ze sprawami kryminalnymi w Pearl Harbor na Hawajach. Śledztwa dotyczą ewentualnych zagrożeń dla bezpieczeństwa narodowego Stanów Zjednoczonych. Funkcjonariuszom pomagają wykwalifikowani specjaliści i lokalni mieszkańcy.Kapitan Milius wraca na Hawaje. Funkcjonariusze NCIS muszą schwytać wyjątkowo niebezpiecznego przestępcę poszukiwanego przez amerykański rząd. Pomocą służy im informator, jakiego wcześniej nie mieli. Tennant i Daniel przyjmują wiadomość o wstąpieniu Alexa do Akademii Marynarki Wojennej.